1968年3月，在陕西凤县温江寺公社谷家庄南家关兴建第1406研究所(超高频电子器件测试设备研究所)，主要任务是负责研制测试超高频电真空和微波半导体器件所需的测试设备、仪器、微波元件等。四十一所诞生了。在三线艰苦条件下，四十一所的开拓者们经历了十年的艰苦奋斗，先后完成了十多项课题的研究，部分课题获得了全国科学大会奖和电子工业部科技进步奖。
通闭塞和自然灾害的侵袭，地处秦岭腹地的四十一所面临着重重困难，科研生产停顿，职工生活没有保障。1982年3月，经第四机械工业部批准，四十一所开始成建制分期分批迁入安徽省蚌埠市。经过近十年的努力，四十一所的创业者们克服了资金短缺、场地狭窄的种种困难，边搬迁、边建设、边科研、边生产，终于在淮河岸边建成我国唯一的电子测量仪器研究所—华东电子测量仪器研究所。
为了满足现代化建设的需要，经批准，1991年，41所开始在山东青岛经技术开发区建设青岛分部，实施微波/毫米波测试专业的重心转移。又是一个从无到有，从小到大的创业历程，一座高科技的电子测试仪器研发基地在黄海之滨建成。
为了加强科研力量，吸引高水平技术研发人才，2010年41所将部分科研转移至青岛，设立八个研发部分别从事微波/毫米波测量、光通信测量、数字通信测量、无线电通信测量、自动测试系统集成、有源和无源微波部件等八个方向的产品研发工作。
2013年，中国电子科技集团公司为加快仪器产业和相关元器件产业发展，加快集团公司内部资源整合，加强优势互补，战略协同，提高在市场的竞争力和核心技术能力，决定将41所和40所一体化运营。